电子信息工程系隶属于我校通信与信息工程学院。本系可追溯至1960年6月成立的上海工学院仪表无线电系；1972年4月，上海工学院、上海科学技术大学、上海机械工程学院三校专业调整时，并入上海科学技术大学的自动控制系；1978年10月返回上海工学院的自动化系；而在1989年2月，由钱伟长校长倡导，正式建立上海工业大学电子与通信工程系。直到1994年四校合并成立上海大学以后，改名为“电子信息工程系”。
电子信息工程系在上海市重点建设学科(2001-2008)、“211”工程(2008)、上海市高水平大学建设(2016)等项目支持下，建设了国家级工程实践教育/技术训练中心，教育部实验室，市级实验教学示范中心，校企联合实践基地等教学科研平台。电子信息工程系是“特种光纤与光接入网”省部共建重点实验室和“新型显示技术与应用集成”教育部重点实验室的重要组成部分，并建成“上海市3D内容制作专业技术服务平台”，拥有数字视音频处理与多媒体传输研究中心。此外，还拥有两个卓越工程师教师实习培训基地（中兴通讯、上海美维电子有限公司），三个“国家级工程实践教育中心”（上海大学-中国电信、上海大学-中兴通讯、上海大学-上海美维电子有限公司）。
电子信息工程系目前主要包括智能视觉信息处理、网络空间安全、智能信息处理三个学科团队，以及跨系所的智能物联、光电信息处理两个学科团队。全系教师以国家目标和战略需求为导向，以服务上海市经济建设发展为目标，瞄准国际科技前沿问题开展科学研究，已经在面向国家重大需求、关系民生的重要领域产出了一大批重大创新成果，承担国家科技部支撑计划、国家自然科学基金重点、军口重点等科研项目，并获得多项国家级和省部级科技奖项。
电子信息工程系拥有一支实力雄厚的高水平师资队伍，具有丰富的教学和学生培养经验，通过构建知识体系、工程实践、创新创业三维一体的人才培养模式，支撑“课内外联动、科教融合、校企协同”的新工科人才培养模式，旨在培养具备创新思维禀赋、学习能力持续、人文素养扎实、国际视野开阔的领域引领人才。在工程教育、优秀本科生培养方面走出了自己的特色，在全国大学生电子设计竞赛中多次获得国家奖，本科生继续深造比例大于50%，并且进入世界500强企业就业人数连续居全校第一。历年来为上海市相关学科的企事业单位和研究机构提供大批人才，不少毕业生已成为生产和科研的骨干，在社会上有良好信誉。